【自然资源】动植物  海口处在橡胶、胡椒等热带经济作物产区，拥有林地9.58万公顷，约占土地面积的42%。地上有野生植物1356种，其中海南特有的40多种，被列为国家一级保护的有苏铁、坡垒、海南黄花梨3种，国家二级保护的有黄檀、粗榧、土沉香、见血封喉等10多种。乔、灌木180多种，其中80多种属经济价值较高的树种，如橡胶、椰子、棕榈、龙眼、荔枝、波罗蜜、咖啡、黄皮、莲雾、胡椒、槟榔等。药用植物1200多种，其中较有名的有巴戟、益智、砂仁等。境内有野生陆栖脊椎动物140种，其中红胸角雉、山鹧鸪、海南虎斑鳽（jiān）等5种为海南特有种；被列入国家一、二类重点保护名录的有蟒蛇、唐鱼、海南山鹧鸪等13种。

海洋资源  海口有791平方千米的海域、上百平方千米的海湾滩涂，有利于发展海洋捕捞及海水养殖。管辖海域内有海岛15个，岛屿面积24.42平方千米，其中有居民海岛1个即北港岛；自西向东分布着诸多天然港湾，如金沙湾、新海港、秀英港、海口湾、东海岸、东寨港等。其中，海口港为海南交通枢纽和客货集散中心，是中国大陆沿海港口到东南亚各地通航贸易船舶的必经之港，素有“琼州门户”之称。港口岸线资源丰富，从西到东可分为马村岸段、盈滨—天尾岸段、海口湾岸段等多个岸段。马村岸段10米等深线离岸1500～1700米；盈滨—天尾岸段港湾开阔，对巨型船舶稳泊条件较好，适宜建深水港；海口湾的稳泊条件好，可建设大型港口。海洋渔业资源主要有鱼类、虾类、蟹类、贝类等。其中，鱼类有100多种，常见且质优的鱼类有马鲛鱼、黄花鱼、鲻、金线鱼、石斑鱼、海鲤鱼等；虾类有斑节对虾、沙虾、青虾等；蟹类有锯缘青蟹、小蟹、花蟹、膏蟹、梭子蟹等；头足类与贝类有乌贼、墨鱼、鲍鱼、泥蚶、牡蛎等；大型藻类主要为长茎蕨藻、麒麟菜、马尾藻等；传统药用海洋生物有海蛇、海马、海龙、海参、海胆、海星、海兔等。

矿产  至2022年，海口市发现的矿产资源有15种，分别为褐煤、耐火黏土、高岭土、油页岩、沸石、膨润土、铝土矿、钴土矿、褐铁矿、砖瓦黏土、硅藻土、建筑用玄武岩、砖瓦用页岩、矿泉水、地热水。